蛋白质交互作用

蛋白质相互作用 (PPI) 是两个或多个蛋白质分子之间建立的高度特异性的物理接触，这是由静电力、氢键和疏水效应等相互作用引导的生化事件的结果。 许多是与特定生物分子环境中细胞或活生物体中发生的链之间的分子关联的物理接触。

蛋白质很少单独行动，因为它们的功能往往受到调节。 细胞内的许多分子过程都是由分子机器执行的，这些分子机器由许多由其 PPI 组织的蛋白质成分构建而成。 这些生理相互作用构成了所谓的生物体相互作用组学，而异常的 PPI 是多种聚集相关疾病的基础，例如克雅氏病和阿尔茨海默病。

已通过多种方法从不同的角度对 PPI 进行了研究：生物化学、量子化学、分子动力学、信号转导等。 所有这些信息都有助于创建大型蛋白质相互作用网络——类似于代谢或遗传/表观遗传网络——从而增强当前关于生化级联反应和疾病分子病因学的知识，以及发现具有治疗意义的推定蛋白质靶点。

要描述蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 的类型，重要的是要考虑蛋白质可以以瞬态方式相互作用（在短时间内产生某些特定效果，如信号转导）或以稳定的方式与其他蛋白质相互作用 形成复合物的方法，这些复合物成为生命系统中的分子机器。 蛋白质复合物组装可导致同源寡聚或异源寡聚复合物的形成。 除了传统的复合物，如酶-抑制剂和抗体-抗原，还可以在结构域-结构域和结构域-肽之间建立相互作用。

识别蛋白质-蛋白质相互作用的另一个重要区别是它们的确定方式，因为有测量蛋白质对之间直接物理相互作用的技术，称为“二元”方法，而还有其他技术测量蛋白质组之间的物理相互作用， 没有成对确定蛋白质伙伴，称为“共同复杂”方法。

同源寡聚体是仅由一种蛋白质亚基构成的大分子复合物。 蛋白质亚基组装以蛋白质四级结构中非共价相互作用的建立为指导。 为了恢复到最初的单个单体，同源低聚物的破坏通常需要复合物的变性。