双链脱氧核糖核酸病毒域

双链脱氧核糖核酸病毒域是一个病毒领域，包括编码 HK97 折叠主要衣壳蛋白的所有双链 DNA 病毒。 HK97 折叠主要衣壳蛋白 (HK97 MCP) 是病毒衣壳的主要成分，它储存病毒脱氧核糖核酸 (DNA)。 该领域的病毒还具有许多其他特征，例如二十面体衣壳、病毒衣壳中称为入口的开口、一种在 DNA 包装之前清空衣壳内部的蛋白酶，以及一种包装病毒的末端酶 DNA 进入衣壳。

双链脱氧核糖核酸病毒域成立于2019年，是基于域内病毒的共同特征。 双链脱氧核糖核酸病病毒域中有两组病毒：感染原核生物的有尾噬菌体目尾噬菌体和感染动物的疱疹病毒目疱疹病毒。 带尾噬菌体种类繁多，在世界范围内无处不在，它们可能是最古老的病毒谱系。 疱疹病毒要么与有尾噬菌体有共同的祖先，要么是有尾病毒目中的一个分离组。

尾噬菌体通过从宿主回收有机物质中的养分在海洋生态学中很重要，并且是许多研究的重点，而疱疹病毒与动物（包括人类）的多种疾病有关。 双链脱氧核糖核酸病病毒域中病毒的一个共同特征是，许多病毒能够在宿主体内长期存在而不进行复制，同时仍然能够在未来重新浮出水面。 这方面的例子包括引起反复感染的单纯疱疹病毒和水痘带状疱疹病毒，它最初在生命早期引起水痘，然后在生命后期引起带状疱疹。

双链脱氧核糖核酸病毒域这个名字是 duplo 的合成词，duplo 是双的拉丁词，dna，来自脱氧核糖核酸 (DNA)，指的是创建时王国的所有成员都有双链 DNA 基因组，而 -viria， 这是用于病毒领域的后缀。 双链脱氧核糖核酸病病毒域是单型的，只有一个王国Heunggongvirae，所以王国和王国的定义相同。 Heunggongvirae 名字的前半部分取自粤语“香港”[Hēunggóng]，意为“香港”，近似发音为“香港”，指代大肠杆菌HK97，HK97（香港97）折叠MCP病毒的创始成员，后缀- virae，这是用于病毒王国的后缀。

双链脱核糖核酸病毒域中的所有病毒都包含一个独特的二十面体衣壳，该衣壳由一个主要的衣壳蛋白组成，该衣壳蛋白包含一个独特的折叠结构，称为 HK97 折叠，以噬菌体物种大肠杆菌 HK97 的 MCP 的折叠结构命名 . 尽管双链脱氧核糖核酸病毒域存在显着差异，但该蛋白质的基本结构在该领域的所有物种中都得到保留。 涉及衣壳结构和组装的其他共享蛋白质包括构成衣壳开口的门脉蛋白、在插入 DNA 之前清空衣壳的蛋白酶，以及将 DNA 插入衣壳的终止酶。

在宿主细胞的核糖体合成 HK97 MCP 后，病毒衣壳由它们组装而成，蛋白质相互结合。 衣壳内部含有指导衣壳几何构造的支架蛋白。 在没有单独的支架蛋白的情况下，面向衣壳内部的 HK97 MCP 的 delta 结构域充当支架蛋白。

衣壳上的圆柱形开口称为入口，用作病毒 DNA 的入口和出口，由衣壳 12 个顶点之一的入口蛋白创建。 支架蛋白，可能是 HK97 MCP 的 delta 结构域，被衣壳成熟蛋白酶从衣壳内部移除，衣壳成熟蛋白酶也可能是支架的一部分，在称为 使衣壳内部留空的蛋白水解。

在衣壳组装的同时，病毒 DNA 发生复制，产生多联体，即含有大量病毒基因组拷贝的 DNA 长分子。

由大小两个亚基组成的酶终止酶通过小亚基在细胞内找到病毒 DNA，切割多联体，并产生基因组的末端或末端。 终止酶识别基因组中的包装信号并切割核酸，产生一个与其结合的游离端。

现在与多联体结合的终止酶将自身附着到衣壳入口，并开始利用大亚基 ATP 水解产生的能量将 DNA 从衣壳外部转移到内部。 随着更多的 DNA 被插入衣壳，衣壳变大，变薄，表面变得更平，更有棱角。 一旦基因组完全进入内部，终止酶再次切割多联体，完成包装。