生物模型数据库

生物模型数据库是一个免费的开源存储库，用于存储、交换和检索生物兴趣的定量模型，创建于 2006 年。生物模型数据库数据库精选部分中的所有模型都已在同行评审的科学文献中进行了描述。

生物模型数据库 curated 分支中存储的模型符合模型管理和注释标准 MIRIAM。 策展人对这些模型进行了模拟，以检查在模拟中运行时，它们是否提供与出版物中描述的相同的结果。 模型组件带有注释，因此用户可以方便地识别每个模型元素并从其他资源中检索更多信息。

模型的反应网络以一些图形格式呈现，例如 PNG、SVG 和图形 Java applet，其中一些网络按照系统生物学图形符号表示。 每个模型的人类可读摘要以 PDF 格式提供。

生物模型数据库由几个分支组成。 策划分支托管经过精心策划和注释的模型。 non-curated-branch 提供仍未策划、不可策划（空间模型、稳态模型等）或太大而无法策划的模型。 非精选模型稍后可以移至精选分支中。 该存储库还托管从路径数据库自动生成的模型。